Верхний храм состоит из двусветного одноглавого четверика с алтарем, притвором и колокольней. Внизу помещался тёплый придел Фрола и Лавра. В настоящее время заброшена.
В XVI в. Ненашевское принадлежало Юрьевскому Архангельскому мужскому монастырю.
Царь Иоанн Грозный и его сын царь Феодор Иоаннович дали монастырю жалованные тарханные грамоты на вотчины, в числе которых и Ненашевское; но эти грамоты при разорении г. Юрьева поляками и литовцами сгорели.
О времени первоначального основания церкви в селе сведений не сохранилось, но, несомненно, она весьма древнего происхождения и уже существовала в XVI в., так как в вышеупомянутых царских грамотах Ненашевское показано селом. В XVII в. в нём была деревянная церковь в честь Святых мучеников Флора и Лавра.
Деревянная церковь Флора и Лавра существовала почти до конца XVIII в.
В 1782 г. за ветхостью она была упразднена, вместо неё прихожане своими средствами построили каменную двухэтажную церковь с каменной же колокольней. В 1855 г. сделана каменная с железными решётками ограда. Земли при церкви: усадебной около одной десятины, сенокосной три десятины и пахотной 30 десятин.
Скорбященская церковь двухярусная. Состояние аварийное, кровель нет. Верхний этаж без столярных заполнений проемов открыт ветрам и осадкам. Цоколь закрыт железными ставнями и используется под склад. Доступа вовнутрь нет, лестница на верхний ярус разобрана.